Le califat de Rashidun prend effectivement fin avec l'assassinat d'Ali, le dernier calife.

Ali ibn Abi Talib , le quatrième calife Rashidun et premier imam chiite , a été assassiné le 26 janvier 661 par un Kharijite nommé Abd al-Rahman ibn 'Amr ibn Muljam al-Muradi à la Grande Mosquée de Kufa , située dans l'actuel Irak. Ali est mort des suites de ses blessures deux jours après qu'Abd al-Rahman l'ait frappé à la tête avec une épée empoisonnée. Il avait 62 ou 63 ans au moment de sa mort le 21 (ou 19) Ramadan 40 AH, équivalent au 28 janvier 661 CE.Ali a été élu calife après l'assassinat d'Uthman en 656 mais a dû faire face à l'opposition de certaines factions. y compris Mu'awiya, le gouverneur sortant de la Syrie actuelle. En conséquence, la première guerre civile musulmane, connue sous le nom de Première Fitna, a suivi l'assassinat d'Uthman, s'est poursuivie tout au long du règne de quatre ans d'Ali et s'est terminée par le renversement du califat de Rashidun et l'établissement de la dynastie des Omeyyades par Mu 'awiya. Notamment, quand Ali a accepté l'arbitrage avec Mu'awiya après la bataille de Siffin en 657, une faction de son armée s'est révoltée contre lui. Ceux-ci devinrent plus tard connus sous le nom de Kharijites ( Khawarij , allumé «ceux qui font sécession»). Ils ont rapidement commencé à terroriser la population civile et ont été écrasés par les forces d'Ali lors de la bataille de Nahrawan en juillet 658. Ibn Muljam a rencontré à La Mecque deux autres Kharijites, à savoir al-Burak ibn Abd Allah et Amr ibn Bakr al-Tamimi, et a conclu qu'Ali, Mu'awia et son gouverneur d'Égypte, Amr ibn al-As, étaient à blâmer pour la guerre civile. Ils ont décidé de tuer les trois afin de résoudre la "situation déplorable" des musulmans et aussi de venger leurs compagnons tombés à Nahrawan. Avec l'intention de tuer Ali, Ibn Muljam s'est dirigé vers Kufa, où il est tombé amoureux d'une femme dont le frère et le père ont également été tués à Nahrawan. Elle a accepté d'épouser Ibn Muljam à la condition qu'il tue Ali et l'a également aidé dans l'entreprise. Après avoir poignardé Ali à la Grande Mosquée de Kufa, Ibn Muljam a été exécuté comme punition par le fils aîné d'Ali, Hasan.

Le califat de Rashidun ( arabe : اَلْخِلَافَةُ ٱلرَّاشِدَةُ , romanisé : al-Khilāfah ar-Rāšidah ) a été le premier califat à succéder au prophète islamique Muhammad . Il a été gouverné par les quatre premiers califes successifs (successeurs) de Mahomet après sa mort en 632 CE (AH 11). Ces califes sont collectivement connus dans l'islam sunnite sous le nom de Rashidun, ou califes "bien guidés" (اَلْخُلَفَاءُ ٱلرَّاشِدُونَ, al-Khulafāʾ ar-Rāšidūn). Ce terme n'est pas utilisé dans l'islam chiite, car les musulmans chiites ne considèrent pas le règne des trois premiers califes comme légitime. Le califat de Rashidun est caractérisé par une période de vingt-cinq ans d'expansion militaire rapide suivie d'une période de cinq ans de conflit. L'armée Rashidun comptait plus de 100 000 hommes à son apogée. Dans les années 650, en plus de la péninsule arabique, le califat avait subjugué le Levant à la Transcaucasie au nord; l'Afrique du Nord de l'Egypte à la Tunisie actuelle à l'ouest ; et le plateau iranien à certaines parties de l'Asie centrale et de l'Asie du Sud à l'est. Les quatre califes Rashidun ont été choisis par un petit corps électoral composé de membres éminents de la confédération tribale Quraysh appelée shūrā (arabe : شُـوْرَى, lit. 'consultation'). Le califat est né de la mort de Muhammad en 632 CE et du débat qui a suivi sur la succession à sa direction. Abu Bakr, un proche compagnon de Muhammad du clan Banu Taym, a été élu premier chef Rashidun et a commencé la conquête de la péninsule arabique. Il a régné de 632 à sa mort en 634. Abu Bakr a été remplacé par Umar, son successeur désigné du clan Banu Adi, qui a poursuivi la conquête de la Perse, conduisant finalement à la chute de l'empire sassanide en 651. Umar a été assassiné en 644 par un esclave persan et a été remplacé par Uthman, membre du clan Banu Umayya, qui a été élu par un comité de six personnes organisé par Umar. Sous Uthman, la conquête de l'Arménie, du Fars et du Khorasan a commencé. Uthman a été assassiné par des rebelles égyptiens en 656 et succédé par Ali, membre du clan Banu Hashim de Muhammad, qui a présidé la guerre civile connue sous le nom de First Fitna (656–661) . La guerre était principalement entre ceux qui croyaient qu'Uthman avait été tué illégalement, soutenant son cousin et gouverneur du Levant Muawiyah, et ceux qui croyaient que son meurtre était mérité, soutenant le calife Ali. La guerre civile a définitivement consolidé le fossé entre les musulmans sunnites et chiites, les musulmans chiites croyant qu'Ali était le premier calife et imam légitime après Muhammad, favorisant son lien de sang avec Muhammad. De plus, une troisième faction dans la guerre croyait qu'Ali et Muawiyah devraient être déposés et un nouveau calife élu par la choura ; cette faction a soutenu le gouverneur de l'Egypte Amr ibn al-As. La guerre a conduit à la fin du califat de Rashidun et à l'établissement du califat omeyyade en 661 sous Muawiyah.